Le temple Amanosan Kongo-ji a été fondé par SOGYOKI, un prêtre de haut rang de la période Nara, et a été reétablit par SHONIN Akan à la fin de la période Heian. A l’époque, plus de cent temples annexes entouraient les principaux monastères de l’enceinte. De nos jours, bien que la plupart des temples annexes aient été supprimés ou intégrés entre les périodes Edo et Meiji, le Tsukiji-bei (enceinte de torchi doté d’un toit filant) et certains des bâtiments restants sont toujours utilisés actuellement. L’ensemble présente aussi des éléments architecturaux construits à des époques plu récentes, comme le Grand Hall d’Entrée (1909), la Grande Salle d’Assemblée et la salle à manger (1942). Malgrés une disparité historique, ces derniers contribuent aussi au paysage architectural et culturel de l’ensemble.